[kevshaw@451]$ history
     1  date
     2  cd p3
     3  ls
     4  nano tgif2ly
     5  primer3_core tgif2ly
     6  nano prim
     7  cat prim
     8  blastn -db human_genomic -query prim -word_size 7 -e_value 10000 | less
     9  blastn -db human_genomic -query prim -word_size 7 -evalue 10000 | less
    10  cd
    11  mkdir seq
    12  cd seq
    13  wget http://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta/saccharomyces_cerevisiae/dna/Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa.gz
    14  ls
    15  gzip -dv Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa.gz
    16  ls -al
    17  less Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa
    18  grep '^>' Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa
    19  mv Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa yeast.fa
    20  ls
    21  samtools index yeast.fa
    22  samtools faidx yeast.fa
    23  ls
    24  cat yeast.fa.fai
    25  grep '^>' Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.dna_sm.toplevel.fa
    26  grep '^>' yeast.fa
    27  bwa index yeast.fa
    28  ls
    29  less yeast.fa.bwt
    30  ls
[kevshaw@451]$