[kevshaw@451]$ history
     1  cd doc
     2  ls
     3  source /usr/local/bin/iwannadock
     4  adt &
     5  ls
     6  prepare-receptor4 -r 1dfr.pdb -A hydrogens -e True
     7  ls
     8  less 1dfr.pdbqt
     9  prepare-ligand4 -l folate.mol2
    10  less folate.mol2
    11  ls
    12  prepare-gpf4 -p spacing='0.375' -p gridcenter='29.935,14.57,-0.265' -p npts='74,74,86' -r 1dfr.pdbqt -l folate.pdbqt
    13  ls
    14  less 1dfr.gpf
    15  prepare-dpf4 -r 1dfr.pdbqt -l folate.pdbqt
    16  ls
    17  less folate_1dfr.dpf
    18  autogrid4 -p 1dfr.gpf
    19  ls
    20  autodock4 -p folate_1dfr.dpf
    21  history
    22  ls
    23  ls -l
    24  top
    25  ls
    26  less folate_1dfr.dlg
    27  top
    28  ls
    29  less folate_1dfr.dlg
    30  ls
    31  cd ..
    32  mkdir ps7
    33  cd ps7
    34  wget https://yea4.us/451/ps/ps07/3l3n.tar.gz
    35  wget https://yea4.us/451/ps/ps07/007.tar.gz
    36  wget https://yea4.us/451/ps/ps07/pscrp.gz
    37  ls
    38  gzip -dv pscrp.gz
    39  ls
    40  chmod +x pscrp
    41  ls
    42  tar xvfz 007.tar.gz
    43  ls
    44  tar zxvf 3l3n.tar.gz
    45  ls
    46  less params
    47  ./pscrp
    48  vina --config params --ligand 007/007.pdbqt --out 007/out.pdbqt --log 007/007.dk
[kevshaw@451]$