[kevshaw@451]$ history
     1  mkdir mt
     2  cd mt
     3  gfp -f 2aai
     4  ls
     5  less 2AAI.pdb
     6  naccess 2AAI.pdb
     7  less 2AAI.rsa
     8  grep ^RES 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | less
     9  grep '^RES.* A " 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | less
    10  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | less
    11  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | less
    12  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | grep ' 0.0$'
    13  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | less
    14  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | grep ' 0.0$'
    15  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | grep '0.0$'
    16  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | less
    17  less 2AAI.pdb
    18  grep '^ATOM.* A ' 2AAI.pdb | less
    19  grep '^ATOM.* A ' 2AAI.pdb > 2aaia.pdb
    20  gfp -fc 2aaia
    21  ls
    22  ls -l
    23  tail 2aaia.pdb ; tail 2AAIA.pdb
    24  naccess 2aaia.pdb
    25  grep '^RES.* A ' 2aaia.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-42 | less
    26  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | less
    27  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-40 | less
    28  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep 0.0$ | less
    29  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep ' 0.0$' | less
    30  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep ' 0.0$' | wc -l
    31  grep '^RES.* A ' 2aaia.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep ' 0.0$' | wc -l
    32  grep '^RES.* A ' 2AAI.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep ' 0.0$' > 2aai.tmp
    33  grep '^RES.* A ' 2aaia.rsa | sort -n -k 8 | cut -c1-41 | grep ' 0.0$' > 2aaia.tmp
    34  diff 2aai.tmp 2aaia.tmp
    35  ls
    36  grep '^SEQRES.* A ' 2AAI.pdb
    37  grep '^SEQRES[0-9 ] A ' 2AAI.pdb
    38  grep '^SEQRES[0-9 ]* A ' 2AAI.pdb
    39  less 2AAI.rsa
    40  ls
    41  rm *
    42  gfp -f 1crn
    43  hbplus 1CRN.pdb
    44  ls
    45  less 1CRN.hb2
    46  grep MM 1CRN.hb2
    47  grep MM 1CRN.hb2 | wc -l
    48  grep SS 1CRN.hb2 | wc -l
    49  grep 'MS|SM' 1CRN.hb2 | wc -l
    50  egrep 'MS|SM' 1CRN.hb2 | wc -l
    51  grep 'MS' 1CRN.hb2 | wc -l
    52  grep 'SM' 1CRN.hb2 | wc -l
    53  less 1CRN.hb2
    54  gfp -f 9rnt
    55  hbplus 9RNT.pdb
    56  less 9RNT.hb2
    57  grep MM 9RNT.hb2
    58  grep MM 9RNT.hb2 | wc -l
    59  grep HH 9RNT.hb2 | wc -l
    60  grep HM 9RNT.hb2 | wc -l
    61  grep MH 9RNT.hb2 | wc -l
    62  cd
[kevshaw@451]$